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部分,也就是基因序列的设计自己可以完全跳过。但是单单通过基因工程手段来合成一段已知基因,也并不是一件很容易的事情。
陈峥十分怀念后世那个拥有基因编辑工具的年代,虽然他也想过,通过自己脑中的神秘球体,将cas9基因编辑蛋白直接合成出来。但是这种惊世骇俗的事情,显然不适合在这种被动的情况下进行。
况且,如果这次能平安回到学校,自己的下一步工作就是“研发”crispr技术,他可不想提前将这种逆天的玩意暴露给这些军装外面套白大褂的家伙,天知道他们还会干出什么事情。
那么在这个基因编辑工具蛋白还没有广泛普及的时代,想要按照固定序列合成dna或者rna链,最精准的方法,自然是采用化学合成,也就是固态法。
也就是将一段大概由十几个碱基构成的“端子”固定在聚合物底物上,然后向上逐个“安装”新的碱基。这样操作的优势是,可以精准的按照设计好的碱基序列进行合成。
虽然早在77年,我国科学家就已经成功合成过酵母丙氨酸转移核糖核酸与狂犬病毒一样的单链rna。但是,那毕竟只是一段几百个碱基组成的小分子rna。
就算在固态合成技术已经非常成熟的2018年,人类所能合成的最长基因组,也不过是10000个碱基左右。而陈铮所设计的改造狂犬病毒,则是足足18000多个碱基构成。更可怕的是,底物上每增加一个碱基的成功率都只有30%。
即便一次性制备一万个底物,只需要叠加七个碱基上去,所能得到的正确基因组,就只剩下了两个而已。在正常的操作中,每增加3-4个碱基之后,都要对底物进行扩增,然后用重新制备的新底物再次继续合成。所以,这个过程及其漫长。
就算陈铮拥有最先进的设备和大量的物资支持,想要完美合成出一条改造狂犬病毒的单链rna,也得需要数年的时间。更别提基因组完成之后,还要将其逆转录、转录、表达,然后培养制备病毒体等其他工作了。
因此,在半个月内,用固态合成法合成病毒,显然是不现实的。
更现实的方案是,在现有病毒基础上,直接敲掉弃用的基因序列,然后将陈峥预先改造好的基因片段插入即可。
但是这种方法同样存在很大的问题。
首先就是剪切酶的问题。核酸剪切酶是一类具有极高选择性的活性蛋白。他们能够识别特定的碱基序列,然后将其在碱基序列的固定位置切断。
既然要识别固定的序列,那么这种剪切和组合就有了限制,必须在固定的序列位点切开。虽然目前已经发现了近4000种不同特异性的剪切酶,但是真正能够实用化的,也不过一百来种而已。而在现在这个时代,国内能够弄到的,则更是稀少。
而且,这种酶切过程并不是可控的,只要碱基序列中存在符合要求的片段,都会被酶切断。也就是说,即便有了合适的工具酶,也会将记忆切成数量不等的碎片。只能采用大海捞针的形式,从一大堆碎片中,来选择可能正确的碎片来进行dna的聚合重组。
所以,这种方法的工作量依然很大,如果只是陈峥一个人来做的话,恐怕半年时间都不一定能够完成。
然而万幸得是,陈峥对病毒本身的修改并不是很多,原始病毒与他给李健楠等人下毒的病毒,在碱基序列上的区别不会超过100个碱基。只要对方能够提供足够的资源和人手,相信半个月之内完成这项工作,也不是一件不可能的事情。
“行不行?给句话。”刘海军显然等的有些不耐烦了,语气不善的催促道。
陈铮眼中闪过一丝决绝,咬牙切齿的说:“行,不过我需要人手!”
部分,也就是基因序列的设计自己可以完全跳过。但是单单通过基因工程手段来合成一段已知基因,也并不是一件很容易的事情。
陈峥十分怀念后世那个拥有基因编辑工具的年代,虽然他也想过,通过自己脑中的神秘球体,将cas9基因编辑蛋白直接合成出来。但是这种惊世骇俗的事情,显然不适合在这种被动的情况下进行。
况且,如果这次能平安回到学校,自己的下一步工作就是“研发”crispr技术,他可不想提前将这种逆天的玩意暴露给这些军装外面套白大褂的家伙,天知道他们还会干出什么事情。
那么在这个基因编辑工具蛋白还没有广泛普及的时代,想要按照固定序列合成dna或者rna链,最精准的方法,自然是采用化学合成,也就是固态法。
也就是将一段大概由十几个碱基构成的“端子”固定在聚合物底物上,然后向上逐个“安装”新的碱基。这样操作的优势是,可以精准的按照设计好的碱基序列进行合成。
虽然早在77年,我国科学家就已经成功合成过酵母丙氨酸转移核糖核酸与狂犬病毒一样的单链rna。但是,那毕竟只是一段几百个碱基组成的小分子rna。
就算在固态合成技术已经非常成熟的2018年,人类所能合成的最长基因组,也不过是10000个碱基左右。而陈铮所设计的改造狂犬病毒,则是足足18000多个碱基构成。更可怕的是,底物上每增加一个碱基的成功率都只有30%。
即便一次性制备一万个底物,只需要叠加七个碱基上去,所能得到的正确基因组,就只剩下了两个而已。在正常的操作中,每增加3-4个碱基之后,都要对底物进行扩增,然后用重新制备的新底物再次继续合成。所以,这个过程及其漫长。
就算陈铮拥有最先进的设备和大量的物资支持,想要完美合成出一条改造狂犬病毒的单链rna,也得需要数年的时间。更别提基因组完成之后,还要将其逆转录、转录、表达,然后培养制备病毒体等其他工作了。
因此,在半个月内,用固态合成法合成病毒,显然是不现实的。
更现实的方案是,在现有病毒基础上,直接敲掉弃用的基因序列,然后将陈峥预先改造好的基因片段插入即可。
但是这种方法同样存在很大的问题。
首先就是剪切酶的问题。核酸剪切酶是一类具有极高选择性的活性蛋白。他们能够识别特定的碱基序列,然后将其在碱基序列的固定位置切断。
既然要识别固定的序列,那么这种剪切和组合就有了限制,必须在固定的序列位点切开。虽然目前已经发现了近4000种不同特异性的剪切酶,但是真正能够实用化的,也不过一百来种而已。而在现在这个时代,国内能够弄到的,则更是稀少。
而且,这种酶切过程并不是可控的,只要碱基序列中存在符合要求的片段,都会被酶切断。也就是说,即便有了合适的工具酶,也会将记忆切成数量不等的碎片。只能采用大海捞针的形式,从一大堆碎片中,来选择可能正确的碎片来进行dna的聚合重组。
所以,这种方法的工作量依然很大,如果只是陈峥一个人来做的话,恐怕半年时间都不一定能够完成。
然而万幸得是,陈峥对病毒本身的修改并不是很多,原始病毒与他给李健楠等人下毒的病毒,在碱基序列上的区别不会超过100个碱基。只要对方能够提供足够的资源和人手,相信半个月之内完成这项工作,也不是一件不可能的事情。
“行不行?给句话。”刘海军显然等的有些不耐烦了,语气不善的催促道。
陈铮眼中闪过一丝决绝,咬牙切齿的说:“行,不过我需要人手!”